โรงเรียนเทศบาลวัดท่าโพธิ์ ก่อตั้งโดยคณะศิษยานุศิษย์ในพระเดชพระคุณท่านเจ้าคุณพระรัตนธัชมุนี(ม่วง ศิริรัตน์ รัตนชัย) อดีตเจ้าอาวาสวัดท่าโพธิ์ และอดีตเจ้าคณะมณฑล นครศรีธรรมราช – ปัตตานี เพื่อเป็นอนุสรณ์ที่พระเดชพระคุณท่านเจ้าคุณ เป็นผู้ให้กำเนิดการศึกษาในภาคใต้ เปิดสอนครั้งแรกเมื่อวันที่ 18 พฤษภาคม พ.ศ.2482 โดยอาศัยโรงธรรมเก่าในวัดท่าโพธิ์ เป็นที่ทำการเรียนการสอน โดยมี นายระวี ต.ชูนินทร์ เป็นครูใหญ่คนแรก เปิดสอนชั้น ป.1 ถึง ป.4 มีนักเรียนชาย 180 คน และมีครูน้อยอีก 2 คน สังกัดกองการศึกษาประชาบาล กรมสามัญศึกษา กระทรวงศึกษาธิการ
ปี พ.ศ.2490 เทศบาลเมืองนครศรีธรรมราช ได้สร้างอาคารเรียนเป็นตึกชั้นเดียว มี 6 ห้องเรียนราคา 60,000 บาท (หกหมื่นบาท) นอกกำแพงวัด ด้านทิศใต้แล้วย้ายนักเรียนมาเรียนในอาคารดังกล่าว
ปี พ.ศ.2503 โรงเรียนได้เปิดสอนถึงชั้น ป.5 เป็นครั้งแรก แต่สถานที่เรียนไม่เพียงพอ ท่านเจ้าอาวาส (ท่านเจ้าคุณฯพระราชไพศาลมุนี) คณะผู้ปกครองได้ช่วยกันสละทรัพย์และกำลังกายสร้างอาคารเรียนชั้นเดียว 1 หลัง ราคา 6,000 บาท (หกพันบาท) อยู่หลังอาคารตึก (แต่ขณะนี้ชำรุดแล้ว) เมื่อวันที่ 1 เมษายน 2506 เทศบาลเมืองนครนครศรีธรรมราชได้รับโอนโรงเรียนเทศบาลวัดท่าโพธิ์ สังกัดเทศบาล โดยโรงเรียนนี้ได้ชื่อว่าโรงเรียนเทศบาล 3 (วัดท่าโพธิ์) และเปิดสอนตั้งแต่ ชั้น ป.1-7
ปี พ.ศ.2508 เทศบาลได้จัดสร้างอาคารเรียนถาวร เป็นตึก 2 ชั้น 1 หลัง 4 ห้องเรียน ในราคา 395,000 บาท (สามแสนเก้าหมื่นห้าพันบาท) ใช้เป็นที่เรียนชั้น ป.5 – 7
ปี พ.ศ.2509 ได้รับงบประมาณจากเทศบาล ให้สร้างโรงอาหาร 1 หลัง ในราคา 25,000 บาท (สองหมื่นห้าพันบาท)
ปี พ.ศ.2510 ในปีนี้โรงเรียนได้จัดตั้งกองลูกเสือตามระเบียบใหม่ คือลูกเสือสามัญ ที่ 66 และลูกเสือสำรอง กองที่ 135 และได้เปลี่ยนชื่อโรงเรียนจากโรงเรียนเทศบาล 3 (วัดท่าโพธิ์) เป็นโรงเรียนเทศบาลวัดท่าโพธิ์
ปี พ.ศ.2520 ได้รับงบประมาณเป็นเงิน 1,680,000 บาท (หนึ่งล้านหกแสนแปดหมื่นบาท) สร้างอาคารเรียนตึก 3 ชั้น (อาคาร 2) และได้ทำพิธีเปิดเมื่อ 15 มกราคม 2522 เวลา09.15 น.
ปี พ.ศ.2538 ได้รับงบประมาณเป็นเงิน 3,870,000 บาท (สามแสนแปดหมื่นเจ็ดพันบาท) สร้างอาคารเรียน 3 ชั้น 10 ห้องเรียน (อาคาร 3)
ปี พ.ศ.2539 ได้รับงบประมาณเป็นเงิน 1,000,000 บาท (หนึ่งล้านบาท) สร้างโรงอาหาร 1 หลัง
ปี พ.ศ.2540 ได้รับงบประมาณเป็นเงิน 280,000 บาท (สองแสนแปดหมื่นบาท) สร้างรั้วโรงเรียน จำนวน 3 ด้าน คือ ด้านหน้า และด้านข้าง 2 ด้าน
ปี พ.ศ.2542 ได้รับงบประมาณ 2,000,00 บาท (สองล้านบาท) สร้างอาคารเด็กอนุบาล จำนวน 4 ห้องเรียน โดยได้ขอพระราชทานชื่อ “อาคารเฉลิมพระเกียรติ 6 รอบ” เพื่อเป็นการเฉลิมฉลองพระเกียรติในพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวพระชนมายุ 72 พรรษา
ปี พ.ศ.2547 ได้รับงบประมาณ 7,200,000 บาท (เจ็ดล้านสองแสนบาท) จัดสร้างอาคารเรียน 4 ชั้น ใต้ถุนโล่ง และจัดสร้างห้องคอมพิวเตอร์ จำนวน 2 ห้อง งบประมาณ 800,000 บาท (แปดแสนบาทถ้วน)
ปี พ.ศ.2549 ได้รับงบประมาณ 850,000 บาท (แปดแสนห้าหมื่นบาทถ้วน) สร้างห้องสุขานักเรียน
ปี พ.ศ.2551 ได้รับงบประมาณ 340,000 บาท (สามแสนสี่หมื่นบาทถ้วน) สร้างห้องวิทยาศาสตร์จำนวน 1 ห้อง ปี พ.ศ.2551 สร้างรั้วรอบสระน้ำและปรับปรุงภูมิทัศน์ภายในโรงเรียน งบประมาณ 180,000 บาท (หนึ่งแสนแปดหมื่นบาทถ้วน) และปรับปรุงโรงอาหาร งบประมาณ 340,000 บาท (สามแสนสี่หมื่นบาทถ้วน)
ปี พ.ศ.2563 ได้รับงบประมาณ 5,031,000 บาท (ห้าล้านสามหมื่นหนึ่งพันบาทถ้วน) สร้างอาคารเอนกประสงค์